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Modelación y Análisis de datos en Neurociencia

Part I: Introduction to Programming with Matlab

Class materials:

Class 1 (pdf) - Class 1 (ppt) 
Class 3 (pdf) - Class 3 (ppt) - updated 26-4-2011
Class 4 (pdf) - Class 4 (ppt) - updated 3-5-2011
Class 5 (pdf) - Class 5 (ppt) - updated 4-5-2011


Problems:
Class problems - updated 3-5-2011
Deadlines (first version): 
- Day1: 20-4-2011
- Day2: 20-4-2011
- Day3: 3-5-2011
- Day4: 11-5-2011
- Day5: 11-5-2011


Part II: Data Analysis

Class Material:

Paper (Arganda et al. Nat Neurosci 2007)


Day 1:    Presentation (pdf) - updated 10-05-2011
              Problems
              Data set

Day 2-3: Presentation (pdf)
              Problems
              Data set

Part III: Modelación

Modelo Hogkin-Huxley (pdf)
Otros modelos (pdf)

Final Projects
(in Spanish)

Presentación de los proyectos e información:
 Presentation (pdf)



Información general:
Presentación: 25 de mayo 2011, 15:00h
  Seminario IX, UAM (Campus de medicina)
10 minutos de presentación, 5 minutos de preguntas
Introducción al problema
Explicar los datos de partida
Explicar el análisis y su código
Resultados, conclusiones o relevancia del método
Mandar presentación y código a depolaviejalab@gmail.com
Deadline: 25 de mayo 2011, a las 15:00h
Mandar código completo: las funciones que hayas creado, junto con un script que les llame.
Ultimo momento en el que se puede mandar el código para obtener ayuda es el lunes 23 por la noche (para que nos dé tiempo a revisarlo y contestar el martes)


Proyectos:


Sistema nervioso rudimentario: Enunciado    

Trayectoria de un objeto: Enunciado    Datos

Trayectorias en parejas de peces: Enunciado    Datos

Elección de lugar en el pez cebra en base a la presencia de conspecíficos: Enunciado    Datos 1 (dataset, datainfo)     Datos 2 (dataset, datainfo)

Neurona de posición: Enunciado    Datos  (neurona1, neurona2, neurona3, trayectoria)

Estímulo que provoca el disparo de una neurona sensorial en la sanguijuela: Enunciado    Datos 1 (dataset)    Datos 2 (dataset)

Patrón circadiano de actividad y sueño en Drosophila: Enunciado    Datos

Determinar características de actividad y sueño en Drosophila: Enunciado    Datos (control, mutante)

Coexpression génica: Enunciado    Datos





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